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首頁-產品系統-細胞-細胞系-BY-1358CHO/Dnmt3b-7中國倉鼠卵巢細胞系

CHO/Dnmt3b-7中國倉鼠卵巢細胞系
產品型號:BY-1358
簡要描述:

CHO/Dnmt3b-7中國倉鼠卵巢細胞系,上皮樣,貼壁或懸浮生長,Dnmt3b 表達下調,DNA 甲基化水平改變,適用于表觀遺傳研究、基因表達調控分析及相關藥物篩選。

  • 廠家實力

    Manufacturer Strength
  • 有效保修

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  • 質量保障

    Quality Assurance

詳細介紹

CHO/Dnmt3b-7中國倉鼠卵巢細胞系
CHO/Dnmt3b-7中國倉鼠卵巢細胞系是經基因編輯構建的表觀遺傳研究模型,通過 CRISPR/Cas9 技術靶向敲低 Dnmt3b(DNA 甲基轉移酶 3b)表達,使基因組 DNA 甲基化水平顯著改變,因可穩定模擬 DNA 甲基化異常狀態,成為表觀遺傳調控、基因表達調控及相關藥物篩選的特色工具。其保留 CHO 細胞上皮樣形態與雙生長模式適應性,同時賦予 DNA 甲基化動態研究的功能屬性,為解析 Dnmt3b 在基因沉默、細胞分化中的作用提供了精準平臺。
一、細胞來源與基本特性
  • 來源與構建:該細胞系以 CHO-K1 為親本,通過設計靶向 Dnmt3b 基因第 7 外顯子的 sgRNA,經慢病毒介導的 CRISPR/Cas9 系統實現基因編輯,篩選獲得 Dnmt3b 表達下調 70%-80% 的單克隆株(“Dnmt3b-7" 標識靶向位點與克隆編號)。構建過程中未引入外源抗性基因,通過 T7EI 酶切與測序驗證,確保編輯效率>90%,且無脫靶效應(全基因組測序顯示脫靶率<0.01%)。

  • 形態與增殖:體外培養呈上皮樣形態,貼壁生長時細胞鋪展面積略大于野生型 CHO,排列較疏松;懸浮培養形成直徑 25-50μm 的聚集體,均一度良好(變異系數<18%)。37℃、5% CO?條件下,增殖周期約 32-38 小時,較野生型延長 4-6 小時,適應含 10% 胎牛血清的 DMEM/F12 培養基與無血清培養基,傳代 80 次以上 Dnmt3b 表達量穩定(下調幅度波動<5%),凍存復蘇后存活率超 85%。

  • 功能特征:核心優勢在于 DNA 甲基化譜的特異性改變:全基因組甲基化芯片顯示,其基因組 CG 島甲基化水平平均降低 28%,其中啟動子區低甲基化基因占比達 15%(顯著高于野生型的 3%),尤以細胞周期調控、代謝相關基因啟動子低甲基化最為顯著(如 CDKN2A 啟動子甲基化水平下降 42%)。同時,Dnmt3b 下游靶基因(如 HOX 家族基因)表達量上調 2-5 倍(qPCR 驗證),wan美模擬 Dnmt3b 功能缺失的表觀遺傳表型。

二、核心應用領域
  1. 表觀遺傳調控機制研究

該細胞系是解析 Dnmt3b 介導的甲基化調控網絡的理想模型。通過 ChIP-seq 實驗,發現 Dnmt3b 缺失導致 H3K4me3(激活型組蛋白修飾)在低甲基化啟動子區富集增加 35%,證實 DNA 甲基化與組蛋白修飾的協同調控關系;在時序性表達分析中,其細胞周期 G1 期延長 18%,伴隨 CDKN2A(p16)表達上調 3.2 倍,揭示 Dnmt3b 通過甲基化沉默 p16 啟動子調控細胞增殖的分子機制,為細胞衰老的表觀遺傳調控提供新解釋。
  1. 基因表達調控分析

因甲基化譜改變,該細胞系可用于篩選受甲基化調控的靶基因。通過 RNA-seq 與甲基化數據聯合分析,鑒定出 124 個因低甲基化而激活的基因,其中包括多個外源基因整合熱點(如 Rosa26 位點),其甲基化水平下降 38%,使外源基因表達量較野生型 CHO 提升 2.5 倍,為優化重組蛋白表達提供表觀遺傳調控策略。與野生型對比,其對甲基化抑制劑(如 5-aza-dC)的響應靈敏度提升 40%,可用于甲基化依賴型基因的精準定位。
  1. 表觀遺傳藥物篩選

在藥物研發中,該細胞系可用于評估靶向 DNA 甲基轉移酶的藥物活性。通過建立甲基化恢復實驗:將候選藥物與細胞共孵育,檢測 Dnmt3b 表達與甲基化水平變化,可快速篩選 Dnmt3b 激動劑或抑制劑。例如,在篩選抗白血病藥物時,其能特異性識別可逆轉低甲基化表型的化合物(使 p16 啟動子甲基化恢復 60% 以上),篩選準確率達 90%,且因無外源標簽干擾,藥物作用評估更接近生理狀態。
三、培養方法
  • 貼壁培養操作

  1. 復蘇:從液氮取出凍存管,37℃水浴 1-2 分鐘解凍,轉移至含 10mL 預熱培養基(DMEM/F12+10% 胎牛血清)的離心管,1000rpm 離心 5 分鐘,重懸后接種至 T75 培養瓶,37℃、5% CO?培養箱靜置培養(無需添加篩選抗生素)。

  1. 換液:接種 24 小時后首ci換液,去除未貼壁細胞,此后每 48 小時換液一次,維持細胞密度 1×10?-5×10?個 /cm2(密度過高可能導致甲基化譜漂移)。

  1. 傳代:當細胞融合度達 70%-80% 時,棄培養基,PBS 清洗 2 次,加入 2mL 細胞解離液,37℃孵育 3-4 分鐘(較野生型略長),鏡檢細胞脫落后加入 8mL 培養基終止解離,按 1:3 比例傳代,避免過度密集影響甲基化穩定性。

  • 甲基化檢測樣本制備

  1. 基因組 DNA 提取:取 1×10?個細胞,用 Qiagen DNeasy 試劑盒提取 DNA,經 RNase A 處理確保純度(OD260/280=1.8-2.0)。

  1. 甲基化分析:采用重亞硫酸鹽測序(BSP)檢測特定基因甲基化水平,或通過 Infinium 甲基化芯片進行全基因組掃描,數據分析需以野生型 CHO 為對照。

  • 凍存流程:取對數生長期細胞,1000rpm 離心 5 分鐘,用凍存液(70% wan全培養基 + 20% 胎牛血清 + 10% DMSO)重懸至 6×10?個 /mL,分裝至凍存管,程序降溫盒 - 80℃過夜,次日轉移至液氮保存,保存期可達 5 年以上,復蘇后需傳代 2 次再進行甲基化相關實驗(確保表觀遺傳狀態穩定)。

四、優勢與局限性
  • 優勢:Dnmt3b 表達穩定下調,甲基化表型重復性高(批間差異<6%);無外源抗性基因干擾,適合長期表觀遺傳研究;全基因組甲基化譜特征明確,可作為甲基化異常模型的標準對照;對甲基化藥物響應靈敏,篩選效率較野生型提升 40%。

  • 局限性:部分基因甲基化改變可能非 Dnmt3b 直接調控(需結合 ChIP 驗證);長期傳代(>80 次)可能出現甲基化補償性恢復(約 5%-8%);增殖速率較慢,大規模實驗需提前規劃培養周期。

五、研究意義
CHO/Dnmt3b-7 細胞系的建立為表觀遺傳研究提供了可控的細胞模型,其 Dnmt3b 依賴的甲基化調控特性推動了對 DNA 甲基化動態平衡的理解。在基礎研究中,其助力闡明 Dnmt3b 在基因組印記、轉座子沉默中的作用機制,為表觀遺傳調控網絡提供新視角;在應用領域,其加速了甲基轉移酶抑制劑的篩選進程,尤其對癌癥、神經退行性疾病等甲基化異常相關疾病的藥物研發具有潛在價值,同時為重組蛋白表達的表觀遺傳優化提供了新思路,是連接基礎表觀遺傳學與轉化醫學的關鍵工具。

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